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SOCIEDAD. ¿Selección natural positiva en antigua epidemia con coronavirus hace más de 20.000 años?

 

Las señales fuertes de adaptación genética a los coronavirus son evidentes en la población de Asia oriental, las señales son evidentes en varios genes que interactúan con los coronavirus, incluido el SARS-CoV-2. Fuente: Universidad de Adelaida.

Los coronavirus han estado detrás de tres grandes brotes zoonóticos. El primer brote, conocido como SARS-CoV (coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo), se originó en China en 2002 e infectó a más de 8.000 y mató a más de 800 personas. Cuatro años después, el MERS-CoV (coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio) afectó a más de 2.400 y mató a más de 850 personas ( https://www.who.int ). El brote más reciente comenzó a fines de 2019 cuando surgió el SARS-CoV-2 en China, lo que provocó una pandemia en curso (enfermedad por coronavirus 2019 [COVID-19]).
La investigación sobre la epidemiología del SARS-CoV-2 ha revelado que los factores socioeconómicos (por ejemplo, el acceso a la atención médica, las pruebas y la exposición en el trabajo), demográficos y de salud personal juegan un papel importante en la epidemiología del SARS-CoV-2. Además, se han encontrado varios loci genéticos que median la susceptibilidad y la gravedad del SARS-CoV-2 en las poblaciones europeas contemporáneas, uno de los cuales contiene una variante genética que aumenta la susceptibilidad al SARS-CoV-2 que probablemente aumentó en frecuencia en los antepasados ​​de los europeos modernos después de cruzarse con los neandertales.

Una fuerte selección impulsó cambios coordinados en múltiples genes CoV-VIP durante 20.000 años

A lo largo de la historia evolutiva de nuestra especie, la selección natural positiva con frecuencia se ha dirigido a proteínas que interactúan físicamente con los virus, por ejemplo, aquellas involucradas en la inmunidad o utilizadas por virus para secuestrar la maquinaria celular del huésped. En los millones de años de evolución humana, la selección ha llevado a la fijación de variantes de genes que codifican proteínas que interactúan con virus (VIP) ( Datos S1 A) a una tasa tres veces mayor que la observada para otras clases de genes.
La fuerte selección de VIP ha continuado en poblaciones humanas durante los últimos 50.000 años, como lo demuestra el enriquecimiento de genes VIP para variantes neandertales introgresadas adaptativas y también señales de barrido selectivo (es decir, selección que impulsa una variante beneficiosa a frecuencias sustanciales en una población), particularmente alrededor de VIP que interactúan con virus de ARN ( Datos S1 B), una clase viral que incluye los coronavirus.

La gente de Asia oriental proviene del área que ahora es China, Japón, Mongolia, Corea del Norte, Corea del Sur y Taiwán. En el curso de la epidemia, la selección favoreció variantes de genes humanos relacionados con la patogénesis con cambios adaptativos que presumiblemente condujeron a una enfermedad menos grave.
El genoma humano moderno contiene información evolutiva que se remonta a decenas de miles de años, como si estudiar los anillos de un árbol nos da una idea de las condiciones que experimentó a medida que crecía
La evidencia acumulada sugiere que las antiguas epidemias de virus ARN se han producido con frecuencia durante la evolución humana; sin embargo, actualmente no sabemos si la selección ha hecho una contribución sustancial a la evolución de los genes humanos que interactúan más específicamente con los coronavirus.
A partir de los datos del estudio, los investigadores infieren que es probable que la epidemia de coronavirus del este de Asia sea un evento grande y prolongado que duró varias generaciones y, en última instancia, "dio forma" al genoma de la población afectada.
Hace que uno se pregunte cómo la pandemia del SARS-CoV-2 pudo dejar su huella en el genoma humano durante los siguientes años. Sin embargo, los científicos enfatizan que esta investigación no implica causalidad. Si bien es muy probable que los cambios en los genomas humanos fueran causados ​​por una epidemia de coronavirus, el trabajo no proporciona una prueba directa.
Al aprender más sobre nuestros antiguos enemigos virales, El reciente estudio destaca la promesa de información evolutiva para predecir mejor las pandemias del futuro. Es importante destacar que la adaptación a antiguas epidemias virales en poblaciones humanas específicas no implica necesariamente ninguna diferencia en la susceptibilidad genética entre diferentes poblaciones humanas, y la evidencia actual apunta hacia un impacto abrumador de los factores socioeconómicos en el caso de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19).
Más información:  An ancient viral epidemic involving host coronavirus interacting genes more than 20,000 years ago in East Asia. Yassine Souilmi, M. Elise Lauterbur, Ray Tobler, Nevan J. Krogan, Kirill Alexandrov, David Enard. Current Biology, June 24, 2021. https://doi.org/10.1016/j.cub.2021.05.067

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