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COVID-19. La prueba de células-T como fuente de exposición al coronavirus

 

Una prueba de células T para detectar COVID-19 secuencia el ADN de los TCR (azul oscuro) de una persona para revelar si ha sido infectada. Funte: Juan Gaertner / Biblioteca de fotografías científicas

Una prueba de diagnóstico basada en la secuenciación de células T de memoria específicas del SARS-CoV-2 de larga duración proporciona un complemento a las pruebas de anticuerpos para determinar la exposición previa al SARS-CoV-2.

Tras la autorización de uso de emergencia de la Administración de Drogas y Alimentos de los EE.UU. (FDA) del mes pasado para la prueba T-Detect COVID-19 de Adaptive Biotechnologies, las pruebas de rutina de células T han entrado en una nueva era. La prueba adaptativa implica una secuenciación de próxima generación basada en laboratorio para identificar las células T que reconocen los antígenos del SARS-CoV-2. La prueba no está destinada al diagnóstico de una infección activa, sino que es un complemento de las pruebas de anticuerpos que se utilizan para confirmar infecciones recientes o anteriores. El procedimiento de laboratorio, que tiene un tiempo de respuesta de siete a diez días, ahora está autorizado para su uso en muestras tomadas de individuos al menos 15 días después de la aparición de los síntomas.

El interés creciente se centra en el papel de la inmunidad de las células T en la lucha contra la infección por SARS-CoV-2 y en proporcionar resistencia a la reinfección. Un nuevo análisis de células T de personas que se recuperaron de COVID-19 ha confirmado que permanecen activas contra tres de las nuevas variantes preocupantes del SARS-CoV-2: B1.1.7, B.351 y B.1.1.248. El estudio , realizado por un equipo del Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas (NIAID) de EE.UU., la Facultad de Medicina de la Universidad Johns Hopkins, la Facultad de Salud Pública Bloomberg de Johns Hopkins y la empresa de biotecnología ImmunoScape, con sede en Singapur, aumentará aún más la confianza de que la eficacia de las vacunas desarrolladas contra la cepa pandémica original no se verá demasiado comprometida a medida que estas nuevas variantes, y otras, se propaguen más ampliamente.

Hasta ahora, los investigadores se han basado principalmente en el uso de análisis de flujo lateral o pruebas de ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA) para los anticuerpos del SARS-CoV-2 para determinar si una persona ha estado expuesta al virus. Se ha considerado fundamental comprender la respuesta de los anticuerpos neutralizantes para establecer la protección contra el virus. Aunque son críticos, los anticuerpos son parte de un conjunto más amplio e incompleto de respuestas inmunes humorales y celulares, que ha recibido poca atención. Estos incluyen funciones de anticuerpos adicionales, tales como citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos, activación del complemento y reclutamiento de fagocitos. Desentrañar su contribución a la inmunidad al SARS-CoV-2 es un desafío continuo. 

Lo mismo puede decirse de analizar la inmunidad mediada por células T. El estudio del NIAID se basó en una compleja prueba de laboratorio para identificar epítopos de células T específicos del SARS-CoV-2, empleando una combinación de citometría de masas y tinción combinatoria de tetrámeros unidos al complejo de histocompatibilidad principal (MHC) de péptido. La complejidad del ensayo y los datos generados necesariamente limitan el uso del ensayo en laboratorios especializados.

La prueba de secuenciación de Adaptive Biotechnologies proporciona una opción más sencilla. En un estudio de validación clínica , el ensayo T-Detect COVID alcanzó una sensibilidad del 97,1% (definida como un porcentaje de concordancia positiva) y una especificidad del 100% (definida como un porcentaje de concordancia negativa) en comparación con las pruebas de PCR a partir de 15 días o más después del diagnóstico.

La prueba surgió de una colaboración de larga data entre Adaptive y Microsoft para aplicar el aprendizaje automático para definir las 'reglas' según las cuales los receptores de células T (TCR) identifican sus antígenos afines. Eso, combinado con una extensa caracterización genómica de los repertorios de células T de personas infectadas con SARS-CoV-2, permitió a Adaptive definir un amplio conjunto de TCR que son indicativos de infección con el virus. La prueba secuencia el repertorio total de TCR presente en una muestra dada y luego calcula el enriquecimiento relativo para los TCR específicos del SARS-CoV-2 en comparación con los umbrales predefinidos para determinar el resultado, teniendo en cuenta la variación en las respuestas inmunes de los individuos.

Los métodos tradicionales de prueba de células T, como la mancha inmunoabsorbente ligada a enzimas (ELISpot) y la tinción de citocinas intracelulares, requieren que los científicos midan directamente la producción de citocinas de las células T después de la estimulación antigénica en condiciones específicas. Las muestras pueden enviarse a temperatura ambiente y congelarse durante períodos prolongados. La nueva prueba también es más precisa que los métodos tradicionales que solo permiten medir simultáneamente una pequeña cantidad de antígenos peptídicos. Y debido a que las respuestas de las células T duran más que las respuestas de los anticuerpos, la prueba también proporciona una ventana más amplia para establecer si un individuo ha sido infectado o no.

Una aplicación inmediata de la prueba será monitorear la efectividad de las diversas vacunas que se están implementando, particularmente en poblaciones vulnerables. “Aún no sabemos cuánto va a durar la inmunidad”, dice Joaquín Martínez-López, del Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas de España en Madrid, quien colaboró ​​con Adaptive en el desarrollo de la prueba.

Alemania, también está desarrollando un diagnóstico de células T basado en secuenciación de próxima generación, habiendo firmado un acuerdo con TScan Therapeutics, que le proporcionará acceso a la propiedad intelectual de esta última y a los datos asociados para varios paneles de epítopos en SARS-CoV-2 que son reconocidos por las células CD8 + de pacientes que se recuperan de COVID-19. Los científicos de TScan han identificado de tres a ocho epítopos para cada uno de los seis tipos de antígenos leucocitarios humanos más comunes en personas convalecientes de COVID-19.

Más información: Sheridan, C. COVID-19 testing turns to T cells. Nat Biotechnol 39, 533–534 (2021). https://doi.org/10.1038/s41587-021-00920-9


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