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COVID-19. Una mutación del virus que causa el Coronavirus domina los nuevos contagios


Una nueva investigación muestra que un cambio específico en el genoma del virus del coronavirus SARS-CoV-2, previamente asociado con una mayor transmisión viral y la propagación de COVID-19, es más infeccioso en el cultivo celular.
La investigación publicada en la revista Cell muestra que un cambio específico en el genoma del virus del coronavirus SARS-CoV-2, previamente asociado con una mayor transmisión viral y la propagación de COVID-19, es más infeccioso en el cultivo celular. La variante en cuestión, D614G, hace un cambio pequeño pero efectivo en la proteína 'Spike' que el virus usa para ingresar en las células humanas.
Bette Korber, bióloga teórica en el Laboratorio Nacional de Los Alamos y autora principal del estudio, señaló: "La variante D614G nos llamó la atención por primera vez a principios de abril, ya que habíamos observado un patrón sorprendentemente repetitivo".
La información geográfica de las muestras de la base de datos de la secuencia viral GISAID COVID-19 permitió el seguimiento de este patrón altamente recurrente, un cambio en la población viral de la forma original a la variante D614G. Esto ocurrió en todos los niveles geográficos: país, subpaís, condado y ciudad.
Dos líneas independientes de evidencia experimental que respaldan estos resultados iniciales se incluyen en el artículo publicado. Estos experimentos adicionales, dirigidos por la profesora Erica Ollmann Saphire, Ph.D., en el Instituto La Jolla, y por el profesor David Montefiori, Ph.D., en la Universidad de Duke, mostraron que la mutación D614G aumenta la infectividad del virus en el laboratorio. Estos nuevos experimentos, así como una secuencia más extensa y datos clínicos y modelos estadísticos mejorados, se presentan en el artículo de la revista Cell . Queda más trabajo in vivo para determinar las implicaciones completas del cambio.
El virus SARS-CoV-2 tiene una tasa de mutación baja en general (mucho más baja que los virus que causan influenza y VIH-SIDA). La variante D614G aparece como parte de un conjunto de cuatro mutaciones vinculadas que parecen haber surgido una vez y luego se movieron juntas alrededor del mundo como un conjunto consistente de variaciones.
"Es notable para mí", comentó Will Fischer, de Los Alamos, autor del estudio, "tanto que este aumento en la infectividad se detectó mediante la observación cuidadosa de los datos de la secuencia sola, y que nuestros colegas experimentales pudieron confirmarlo con virus vivos en un tiempo corto."
Afortunadamente, "los datos clínicos en este documento de Sheffield mostraron que, aunque los pacientes con el nuevo virus G portaban más copias del virus que los pacientes infectados con D, no hubo un aumento correspondiente en la gravedad de la enfermedad", dijo Saphire, quien lidera el Consorcio de inmunoterapia Coronavirus, apoyado por la Fundación Gates (CoVIC).
Korber señaló: "Estos hallazgos sugieren que la forma más nueva del virus puede transmitirse aún más fácilmente que la forma original; independientemente de si esa conclusión se confirma o no, resalta el valor de lo que ya eran buenas ideas: usar máscaras y mantener el distanciamiento social ".
Los socios de investigación del Laboratorio Nacional de Los Alamos, la Universidad de Duke y la Universidad de Sheffield publicaron inicialmente el trabajo sobre este análisis en el sitio bioRxiv en una preimpresión de abril de 2020. Ese trabajo también incluyó observaciones de pacientes con COVID-19 de Sheffield que sugirieron una asociación de la variante D614G con mayores cargas virales en el tracto respiratorio superior.
"Es posible rastrear la evolución del SARS-CoV-2 a nivel mundial porque los investigadores de todo el mundo están haciendo que sus datos de secuencias virales estén disponibles rápidamente a través de la base de datos de secuencias virales GISAID", dijo Korber. Actualmente, decenas de miles de secuencias están disponibles a través de este proyecto, y esto permitió a Korber y al equipo de investigación identificar la aparición de la variante D614G.
GISAID se estableció para alentar la colaboración entre los investigadores de influenza, pero al principio de la epidemia, el consorcio estableció una base de datos SARS-CoV-2, que pronto se convirtió en el estándar de facto para compartir secuencias de brotes entre investigadores de todo el mundo.

G versus D

Las muestras originales del nuevo coronavirus de Wuhan, China, fueron una variación que los científicos ahora llaman el clado "D". Antes del 1 de marzo, más del 90% de las muestras virales tomadas de pacientes provenían de esta variación D. En el transcurso de marzo, G comenzó a predominar. Esta mutación es causada por el intercambio de un nucleótido de adenina (A) a un nucleótido de guanina (G) en un punto particular en el genoma del coronavirus. Siempre aparece junto con otras tres mutaciones que intercambian de manera similar un bloque de construcción de ARN por otro. (Las letras en el ARN ayudan a codificar las proteínas que el virus produce una vez dentro de una célula). La variante G representó el 67% de las muestras globales tomadas en marzo, y el 78% de las tomadas entre el 1 de abril y el 18 de mayo. Durante este tiempo, el foco de los brotes se desplazó de China a Europa y Estados Unidos.
Fuentes:
- B. Korber, W.M. Fischer, S. Gnanakaran, H. Yoon, J. Theiler, W. Abfalterer, N. Hengartner, E.E. Giorgi, T. Bhattacharya, B. Foley, K.M. Hastie, M.D. Parker, D.G. Partridge, C.M. Evans, T.M. Freeman, T.I. de Silva, C. McDanal, L.G. Perez, H. Tang, A. Moon-Walker, S.P. Whelan, C.C. LaBranche, E.O. Saphire, D.C. Montefiori, on behalf of theSheffield COVID-19 Genomics Group. Tracking changes in SARS-CoV-2 Spike: evidence that D614G increases infectivity of the COVID-19 virusCell, July 2, 2020; DOI: 10.1016/j.cell.2020.06.043
- DOE/Los Alamos National Laboratory. "Newer variant of COVID-19-causing virus dominates global infections: Virus with D614G change in Spike out-competes original strain, but may not make patients sicker." ScienceDaily. ScienceDaily, 2 July 2020.

A new coronavirus mutation is taking over the world. Here's what that means. https://www.livescience.com/new-coronavirus-mutation-explained.html?utm_source=notification

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